15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4141 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  64.67 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  51.9 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  51.27 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  47.17 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1385  hypothetical protein  47.85 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.940229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1817  hypothetical protein  45.4 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  39.77 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  34.33 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  31.88 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0596  hypothetical protein  33.81 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0310086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  26.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  29.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0793  hypothetical protein  27.89 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00522604  normal  0.142472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>