28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3909 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 147 aa  297  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  80 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  56.46 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  57.45 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  55.24 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  55 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  55.1 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.29 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  55.15 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  51.37 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  48.57 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  44.6 
 
 		 162 aa  116  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  42.66 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  36.23 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.79 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.14 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.6 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.8 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.21 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.85 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  24 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 190 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.64 
 
 		 345 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>