38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2284 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  49.44 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  51.69 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  49.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  52.81 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  47.19 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  48.31 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  47.19 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  47.19 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  43.82 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  50.56 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  49.44 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  35.71 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  31.82 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  31.25 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  38.81 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  26.37 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  35.29 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  31.25 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  23.81 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  32.84 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0007  hypothetical protein  34.78 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0011  hypothetical protein  34.78 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0102903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  31.43 
 
 		 643 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  30.77 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  32.35 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  33.85 
 
 		 94 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  27.94 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  29.17 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.145179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>