19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1663 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  63.31 
 
 		 161 aa  183  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  55.06 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  35.34 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  36.36 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  35.45 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  34.82 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  32.74 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  34.44 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.41 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  31.45 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  30.67 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2639  hypothetical protein  29.13 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.36 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  31.82 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  26.24 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>