More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4413 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  100 
 
 
320 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  80.19 
 
 
322 aa  517  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  57.32 
 
 
316 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  56.78 
 
 
329 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  53.44 
 
 
315 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  53.12 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  52.9 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  51.29 
 
 
311 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  48.75 
 
 
325 aa  275  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  48.08 
 
 
325 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  48.08 
 
 
325 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  42.26 
 
 
344 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  48.09 
 
 
311 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  45.06 
 
 
336 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  42.72 
 
 
312 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  40.06 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  40.06 
 
 
319 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  40.8 
 
 
348 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  41.95 
 
 
363 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  41.64 
 
 
313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  41.64 
 
 
313 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  41.64 
 
 
313 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  41.64 
 
 
313 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  42.27 
 
 
313 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  38.37 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  42.5 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  48.21 
 
 
317 aa  215  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  44.86 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  40.24 
 
 
348 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  42.32 
 
 
336 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  43.93 
 
 
323 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  41.3 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  37.81 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  37.62 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  41.11 
 
 
334 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  42.63 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  33.44 
 
 
311 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  33.44 
 
 
311 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  37.04 
 
 
322 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  33.54 
 
 
311 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.39 
 
 
316 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.39 
 
 
316 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  28.36 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  26.09 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.3 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  25.72 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  25 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  26.09 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  24.73 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  24.64 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  24.73 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  24.73 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  24.73 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  24.73 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  25.66 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  25.66 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  25 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  25.77 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  25.77 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  25.43 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  26.69 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  26.64 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  26.64 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  26.01 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.93 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  26.55 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.04 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  25.35 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  26.55 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  26.55 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  26.55 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  26.55 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  23.27 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  27.33 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  25.1 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  28.21 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  26.35 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  27.33 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  25.48 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  26.35 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  27.33 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.52 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  25.83 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.15 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  28.37 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  26.18 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  26.21 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  26.81 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  26.52 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  25.51 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  26.74 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  28.48 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  30.48 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  30.48 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  26.74 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  30.48 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3372  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.36 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537217  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  26.44 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  26.32 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.28 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>