51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0139 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  100 
 
 		 340 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  63.85 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  45.32 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.74 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  29.37 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  28.3 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  29.35 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  30.26 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  28.95 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.36 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  29.33 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  29.33 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  29.33 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  37.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1229  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  26.11 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1906  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.81 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.758127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1581  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.81 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462376  normal  0.0477727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.32 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.35 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.17 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0233634  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1806  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.34 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.278367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.26 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.2 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.2 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.2 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.39 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.44 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.16 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0997  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.16 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0433  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.39 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0463016  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0828  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.67 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.33 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.21 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.56 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.76 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000682633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  22.99 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.1 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1621  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.93 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000245792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1389  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.58 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.93 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.21 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0574  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.89 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.383366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.85 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.27 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>