28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7136 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7136  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000678278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3396  hypothetical protein  29.79 
 
 
380 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3914  Sigma 54 interacting domain protein  24.26 
 
 
464 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000232592  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0071  ABC transporter, ATP-binding protein  26.34 
 
 
212 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3609  AAA ATPase  29.27 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.687866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3762  ABC transporter related  23.83 
 
 
632 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125116  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  29.48 
 
 
744 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  30.77 
 
 
494 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0098  ABC transporter ATP-binding protein  28.49 
 
 
208 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  25.63 
 
 
234 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0926  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
264 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161343  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1283  ATPase  28.8 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  32.09 
 
 
228 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07231  ABC transporter ATP-binding protein  28.32 
 
 
208 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3746  ABC transporter related  25 
 
 
217 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  27.27 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  24.02 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  27.27 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  27.27 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1032  ABC transporter related  29.85 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1061  ABC transporter related  29.85 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  hitchhiker  0.004638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0877  ABC transporter related  29.75 
 
 
210 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2565  ABC transporter related  23.96 
 
 
224 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5582  ABC transporter related  30.13 
 
 
803 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0235423  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26461  ABC transporter ATP-binding protein  30.2 
 
 
225 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1541  ABC transporter related  28.67 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1569  ABC transporter related  28.67 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0173  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.24 
 
 
424 aa  42.7  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>