36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5886 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2028  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  71.45 
 
 
699 aa  942    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5988  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  73.03 
 
 
707 aa  964    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.470652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5886  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  100 
 
 
708 aa  1423    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0736  hypothetical protein  71.92 
 
 
695 aa  942    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.173943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0812  hypothetical protein  71.86 
 
 
696 aa  964    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312439  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2544  hypothetical protein  71.86 
 
 
697 aa  966    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737003  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1890  putative lipoprotein  71.3 
 
 
699 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3184  alpha/beta fold family hydrolase  71.45 
 
 
699 aa  942    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3147  putative lipoprotein  71.6 
 
 
699 aa  944    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2720  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  71.3 
 
 
699 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0886  hypothetical protein  71.3 
 
 
699 aa  938    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0840  hypothetical protein  71.86 
 
 
696 aa  963    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0719  hypothetical protein  71.92 
 
 
695 aa  955    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3200  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  71.6 
 
 
699 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3932  hypothetical protein  71.71 
 
 
696 aa  978    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1420  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  72.6 
 
 
698 aa  929    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2223  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate- oligomer hydrolase  72.02 
 
 
707 aa  961    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0731014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0357  hypothetical protein  71.86 
 
 
696 aa  963    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.915085  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1981  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  50 
 
 
707 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3022  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  51.55 
 
 
704 aa  581  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0965207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1270  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  49.25 
 
 
725 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1209  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  48.56 
 
 
725 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.104805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4732  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  49.93 
 
 
706 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3005  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  49.34 
 
 
750 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120032  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3987  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  50.36 
 
 
718 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0395504  normal  0.53474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1960  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.41 
 
 
722 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0700058  normal  0.240709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3542  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  46.74 
 
 
688 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.078354  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4280  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  45.77 
 
 
729 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1334  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  46.97 
 
 
725 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.486001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0749  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  46.9 
 
 
682 aa  528  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  44.69 
 
 
726 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2556  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  44.28 
 
 
734 aa  472  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.405834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0083  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  41.09 
 
 
700 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3290  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase  39.64 
 
 
678 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  31.62 
 
 
457 aa  55.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8517  hypothetical protein  30.43 
 
 
463 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236902  normal  0.839717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>