29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5512 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 387 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  71.67 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  68.93 
 
 		 355 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  41.79 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.3 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.2 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.24 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  36.93 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.39 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.1 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  33.62 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  37.28 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.55 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.48 
 
 		 375 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.1 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.1 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  38.1 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.24 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.29 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  34.43 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  30.87 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.05 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.18 
 
 		 506 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.65 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  27.66 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  26.61 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  26.4 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  22.75 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  26.42 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>