32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3930 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  56.58 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  57.89 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  55.26 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  45.95 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  45.95 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.96 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.19 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  40.54 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  46.58 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.84 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  43.94 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.18 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  41.03 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  37.04 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.62 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  37.31 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  34.62 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.05 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  35.9 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.99 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.99 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  25.56 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  28.17 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  24.49 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  29.63 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>