40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3974 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  53.92 
 
 
663 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
720 aa  1402    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  79.7 
 
 
688 aa  1011    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  78.3 
 
 
699 aa  999    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  79.7 
 
 
688 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  79.61 
 
 
679 aa  1002    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  79.7 
 
 
688 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  58.36 
 
 
665 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  52.85 
 
 
671 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  78.45 
 
 
773 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  49.16 
 
 
680 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  44.36 
 
 
660 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.15 
 
 
633 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  38.15 
 
 
633 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  36.07 
 
 
600 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  29.44 
 
 
708 aa  178  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  26.53 
 
 
683 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  26.53 
 
 
683 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.53 
 
 
683 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  26.53 
 
 
683 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  26.35 
 
 
683 aa  145  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  26.8 
 
 
683 aa  145  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  26.65 
 
 
683 aa  143  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  26.35 
 
 
683 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25 
 
 
395 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.57 
 
 
360 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26.4 
 
 
702 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.52 
 
 
697 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.42 
 
 
359 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  30.52 
 
 
720 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  30.66 
 
 
721 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  29.87 
 
 
720 aa  44.3  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  29.87 
 
 
720 aa  44.3  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  29.87 
 
 
720 aa  44.3  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  29.87 
 
 
720 aa  44.3  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  29.87 
 
 
720 aa  44.3  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  29.87 
 
 
717 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  29.87 
 
 
717 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  29.87 
 
 
720 aa  44.3  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.71 
 
 
744 aa  43.9  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>