17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3000 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  46.04 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  41.94 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  39.36 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  40.86 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  40.86 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  37.3 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  33.82 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  32.61 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  32.35 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  31.25 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  34.29 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  26.9 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  26.32 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  26.32 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.18 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>