36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2676 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  50.36 
 
 		 831 aa  791    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  43.89 
 
 		 841 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  44.68 
 
 		 835 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  41.64 
 
 		 826 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  41.95 
 
 		 823 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  45.39 
 
 		 789 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  43.03 
 
 		 830 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  40.68 
 
 		 846 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  38.29 
 
 		 830 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  37.5 
 
 		 847 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  37.62 
 
 		 829 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  37.82 
 
 		 847 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  39.39 
 
 		 845 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  39.38 
 
 		 849 aa  486  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  37.98 
 
 		 825 aa  460  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  33.79 
 
 		 814 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  35.96 
 
 		 835 aa  432  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  34.8 
 
 		 850 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  35.18 
 
 		 847 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  35.36 
 
 		 847 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  34.79 
 
 		 851 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  48.51 
 
 		 376 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  35.9 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.43 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.87 
 
 		 827 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  25.82 
 
 		 795 aa  97.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  24.11 
 
 		 821 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.29 
 
 		 570 aa  67.4  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  20.81 
 
 		 869 aa  54.3  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  23.26 
 
 		 790 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  25.75 
 
 		 858 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  25.75 
 
 		 858 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.88 
 
 		 607 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  25.8 
 
 		 1285 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.1 
 
 		 743 aa  44.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>