12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2313 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2313  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 417 aa  850    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 396 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4868  hypothetical protein  24.82 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3297  hypothetical protein  24.82 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2864  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4944  hypothetical protein  26.32 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 620 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24770  predicted transcriptional regulator with HTH domain protein  29.52 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>