26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  323  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  43.88 
 
 
155 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  44.96 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  47.14 
 
 
154 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  45.65 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  46.88 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  46.49 
 
 
167 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  44.83 
 
 
169 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  42.98 
 
 
146 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  43.08 
 
 
323 aa  88.6  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  36.23 
 
 
156 aa  87  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  40.48 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  37.98 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  35.86 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  35.86 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  34.81 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  39.62 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  35.17 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  40.28 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  28.78 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  32.23 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  31.62 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  31.9 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  29.03 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
125 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>