180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4583 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  87.89 
 
 
224 aa  417  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  88.39 
 
 
224 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  88.39 
 
 
224 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  87.84 
 
 
224 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  87 
 
 
224 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  87 
 
 
224 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  87.67 
 
 
225 aa  407  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  86.16 
 
 
224 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  85.2 
 
 
224 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  65.62 
 
 
238 aa  316  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  32.35 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  30.18 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  29.73 
 
 
233 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  32.16 
 
 
234 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  31.14 
 
 
233 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  30.94 
 
 
233 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  31.78 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  30.93 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  29.07 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  29.91 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  30.42 
 
 
244 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  30.42 
 
 
244 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  30.64 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  30 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  30 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  29 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  30 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  28.94 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  29.28 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  28.33 
 
 
236 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  31.46 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  26.72 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  27.78 
 
 
301 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  28.88 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  27.98 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  27.87 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  28.99 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  28.45 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  27.08 
 
 
487 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  28.51 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  26.57 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  27.76 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  26.57 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  26.57 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  26.89 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  27.66 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  25.85 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  30.61 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  27.04 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  26.09 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  23.81 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  26.7 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  26.96 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  25.35 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  25.99 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  25.35 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  25.96 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  27.67 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  26.09 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  25.12 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  26.21 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  23.81 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  23.81 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  25.12 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  25.12 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  22.36 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  25.59 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  29.15 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  27.07 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  23.38 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  24.06 
 
 
484 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  24.77 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  25.23 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  25.23 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  25.23 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  25.23 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0734  aspartate racemase  27.03 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000319838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  24.67 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  24.4 
 
 
489 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  24.65 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  24.47 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  29.72 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  24.58 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  25.7 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  24.77 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2031  aspartate racemase  23.73 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0604958 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1766  aspartate racemase  25 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  25.18 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  24.24 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  25.23 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  24.31 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  23.18 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  23.73 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  24.06 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  24.11 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  25.18 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  25.42 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  23.47 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  31.31 
 
 
497 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>