23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5908 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5908  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  0.0547842 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  56.18 
 
 		 199 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  56.18 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  56.18 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  56.18 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  56.18 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5664  hypothetical protein  51.65 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5881  hypothetical protein  51.65 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7242  hypothetical protein  37.66 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5239  putative type IV pilus biosynthesis protein  32.11 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5453  hypothetical protein  38.03 
 
 		 142 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0993126  normal  0.0158415 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5551  hypothetical protein  29.69 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0612444 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6565  hypothetical protein  34.67 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3706  hypothetical protein  32.18 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  25.5 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  28.4 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0013  type IV pilus biosynthesis protein PilL  22.54 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5032  hypothetical protein  32 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5454  hypothetical protein  34.91 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131248  decreased coverage  0.00950425 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4231  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 157 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.855851 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4251  hypothetical protein  31.18 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5197  putative pilus-related protein  27.27 
 
 		 174 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>