24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0657 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  363  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  363  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  363  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  363  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  93.97 
 
 
199 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5908  hypothetical protein  57.32 
 
 
337 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  0.0547842 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5664  hypothetical protein  48.31 
 
 
386 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5881  hypothetical protein  48.31 
 
 
412 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7242  hypothetical protein  36.14 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5239  putative type IV pilus biosynthesis protein  31.5 
 
 
133 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539131  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5551  hypothetical protein  30.33 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0612444 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5453  hypothetical protein  34.92 
 
 
142 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0993126  normal  0.0158415 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6565  hypothetical protein  31.17 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5238  hypothetical protein  37.18 
 
 
437 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413163  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4758  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3706  hypothetical protein  34.29 
 
 
250 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5454  hypothetical protein  35.56 
 
 
424 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131248  decreased coverage  0.00950425 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  28.21 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  36.59 
 
 
374 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4251  hypothetical protein  33.77 
 
 
375 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4231  putative lipoprotein  31.3 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.855851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1532  hypothetical protein  24.68 
 
 
174 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5197  putative pilus-related protein  24.68 
 
 
174 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5032  hypothetical protein  28.75 
 
 
199 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>