15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5881 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5881  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5664  hypothetical protein  95.24 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  47.83 
 
 		 199 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  47.83 
 
 		 189 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  47.83 
 
 		 189 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  47.83 
 
 		 189 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  47.83 
 
 		 189 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5908  hypothetical protein  52.44 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  0.0547842 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.54 
 
 		 671 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5551  hypothetical protein  28.95 
 
 		 183 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0612444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  42.68 
 
 		 687 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  37.14 
 
 		 268 aa  46.6  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  39.84 
 
 		 840 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  27.85 
 
 		 195 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>