18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6565 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6565  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  350  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5551  hypothetical protein  66.49 
 
 		 183 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0612444 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  32.53 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4231  putative lipoprotein  35.44 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.855851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  0.0547842 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  30.91 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5881  hypothetical protein  30.26 
 
 		 412 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5664  hypothetical protein  30.26 
 
 		 386 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7242  hypothetical protein  27.14 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  31.48 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4758  hypothetical protein  25.56 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4202  hypothetical protein  22.96 
 
 		 148 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1532  hypothetical protein  25.68 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5197  putative pilus-related protein  25.68 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>