15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3706 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3706  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  35.29 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5908  hypothetical protein  31.76 
 
 
337 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  0.0547842 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5549  hypothetical protein  28.5 
 
 
422 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195272 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6297  hypothetical protein  35.29 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6567  hypothetical protein  35.38 
 
 
428 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7242  hypothetical protein  34.18 
 
 
161 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  34.29 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  34.29 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  34.29 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  34.29 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  34.29 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4758  hypothetical protein  30.68 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5881  hypothetical protein  30.99 
 
 
412 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5664  hypothetical protein  30.99 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>