15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4758 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4758  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  306  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  42.53 
 
 		 195 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7242  hypothetical protein  34.94 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4231  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.855851 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5551  hypothetical protein  23.61 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0612444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3706  hypothetical protein  31.48 
 
 		 250 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  31.65 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  31.65 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  31.65 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  31.65 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  31.65 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6565  hypothetical protein  24.68 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5881  hypothetical protein  28.21 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4251  hypothetical protein  32.61 
 
 		 375 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5664  hypothetical protein  28.21 
 
 		 386 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  hitchhiker  0.00919301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>