31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5115 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  97.75 
 
 
89 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  97.75 
 
 
89 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  88.76 
 
 
89 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  85.39 
 
 
89 aa  159  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  85.39 
 
 
89 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  84.27 
 
 
89 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  77.53 
 
 
114 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  77.53 
 
 
89 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  68.54 
 
 
89 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  55.06 
 
 
89 aa  100  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  48.31 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  43.82 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  46.07 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  52.81 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  46.07 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  52.81 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  42.7 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  42.7 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  37.31 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  31.43 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  26.09 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  26.39 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  28.99 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  29.85 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  34.78 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  25.56 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  30.88 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  30.43 
 
 
90 aa  40  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>