99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1734 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2346  chorismate lyase  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1734  chorismate lyase  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2367  chorismate lyase  98.48 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2262  chorismate lyase  95.79 
 
 		 197 aa  363  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2382  chorismate lyase  94.21 
 
 		 197 aa  357  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0933  chorismate lyase  93.26 
 
 		 204 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5685  chorismate lyase  95.14 
 
 		 198 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0956  chorismate lyase family protein  81.91 
 
 		 200 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0290  chorismate lyase family protein  78.72 
 
 		 200 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1006  chorismate lyase family protein  78.72 
 
 		 200 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.998133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0858  chorismate lyase family protein  78.72 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1319  chorismate lyase family protein  78.72 
 
 		 200 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1168  chorismate--pyruvate lyase  78.72 
 
 		 200 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1946  chorismate lyase family protein  78.72 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1159  chorismate--pyruvate lyase  78.72 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1221  Chorismate lyase  69.11 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3325  chorismate lyase  70.33 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2111  chorismate lyase  70.59 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0464  chorismate lyase  44.44 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0710  chorismate lyase  34.66 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00949148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2859  chorismate lyase  38.18 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3058  chorismate lyase  34.97 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0053  chorismate lyase  36.48 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0823  Chorismate lyase  40 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1215  chorismate lyase superfamily protein  32 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0966  chorismate lyase  41.45 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0938345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3015  chorismate lyase  35.85 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2612  chorismate lyase  31.71 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3594  chorismate lyase  34.16 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3024  Chorismate lyase  36.67 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0048  chorismate lyase  31.07 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0125  putative chorismate--pyruvate lyase  33.33 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0157  chorismate lyase  35.45 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3252  chorismate lyase  35.19 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000207582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5317  chorismate lyase  34.87 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5225  chorismate lyase  34.87 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4826  chorismate lyase  33.33 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2614  Chorismate lyase  35.8 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5364  chorismate lyase  35.29 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2154  chorismate lyase  29.22 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3623  putative chorismate--pyruvate lyase  38.75 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0095  chorismate lyase  30.3 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2780  hypothetical protein  37.34 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48500  Chorismate lyase  37.5 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2049  chorismate--pyruvate lyase  27.37 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4410  chorismate lyase  33.73 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0608691 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0141  putative chorismate--pyruvate lyase  27.37 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6134  hypothetical protein  37.27 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3743  chorismate lyase  30.86 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.219217  hitchhiker  0.000343394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4398  chorismate lyase  31.79 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70720  hypothetical protein  35.58 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3468  chorismate lyase  30.41 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5030  chorismate lyase  37.74 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4464  chorismate pyruvate lyase  33.54 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5603  chorismate lyase  34.12 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0126  chorismate lyase  32.05 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4431  chorismate lyase  29.49 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000175928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0658  chorismate lyase  29.7 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5475  chorismate-pyruvate lyase, putative  34.81 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4425  chorismate pyruvate lyase  31.41 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4148  chorismate lyase  30.63 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4627  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4490  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.232618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4575  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4576  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464602  normal  0.0352552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0243  chorismate pyruvate lyase  28.14 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5520  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4558  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4501  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3989  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3954  Chorismate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03871  hypothetical protein  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4592  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4279  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03911  chorismate pyruvate lyase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0131  chorismate pyruvate lyase  29.94 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3864  chorismate pyruvate lyase  29.28 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3774  chorismate pyruvate lyase  29.28 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0678  chorismate pyruvate lyase  29.28 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0120  chorismate lyase  28.85 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0125  chorismate lyase  28.85 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145702  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0126  chorismate lyase  28.85 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2084  chorismate lyase  32.75 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.133367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3251  chorismate lyase  30.77 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4229  chorismate lyase  27.85 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0125  chorismate lyase  27.85 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0130  chorismate lyase  28.48 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0129  Chorismate lyase  27.85 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1335  chorismate--pyruvate lyase, putative  31.85 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2439  chorismate lyase  32.92 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0510  chorismate pyruvate lyase  25.32 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0729  chorismate pyruvate lyase  26.92 
 
 		 177 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00071  hypothetical chorismate pyruvate lyase  26.28 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1198  chorismate lyase  44.68 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.465197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0066  chorismate lyase  27.98 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.540538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2975  4-hydroxybenzoate synthetase  31.03 
 
 		 100 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0971  chorismate pyruvate lyase  26.92 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00931015  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0289  chorismate lyase  26.96 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0317  chorismate lyase  28.04 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>