64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1198 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1198  chorismate lyase  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.465197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0658  chorismate lyase  72.95 
 
 		 191 aa  193  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3594  chorismate lyase  31.96 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0243  chorismate pyruvate lyase  32.1 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2439  chorismate lyase  30.28 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4592  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3325  chorismate lyase  45.83 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4279  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3989  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4501  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4558  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1221  Chorismate lyase  47.92 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03871  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03911  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3954  Chorismate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0126  chorismate lyase  35.78 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5520  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3743  chorismate lyase  43.48 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.219217  hitchhiker  0.000343394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4826  chorismate lyase  50 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0131  chorismate pyruvate lyase  35.45 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0464  chorismate lyase  38.16 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4431  chorismate lyase  34.52 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000175928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0125  chorismate lyase  41.43 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145702  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3774  chorismate pyruvate lyase  31.58 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0678  chorismate pyruvate lyase  31.58 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3015  chorismate lyase  33.33 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3864  chorismate pyruvate lyase  31.58 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0126  chorismate lyase  41.43 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0120  chorismate lyase  41.43 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126883 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1168  chorismate--pyruvate lyase  44.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0290  chorismate lyase family protein  44.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1159  chorismate--pyruvate lyase  44.68 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1319  chorismate lyase family protein  44.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1946  chorismate lyase family protein  44.68 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0858  chorismate lyase family protein  44.68 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1006  chorismate lyase family protein  44.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.998133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0956  chorismate lyase family protein  44.68 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0130  chorismate lyase  44.68 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2382  chorismate lyase  44.68 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1734  chorismate lyase  44.68 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4229  chorismate lyase  44.68 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2346  chorismate lyase  44.68 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0129  Chorismate lyase  44.68 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0125  chorismate lyase  44.68 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5685  chorismate lyase  44.68 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2262  chorismate lyase  44.68 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2367  chorismate lyase  44.68 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2111  chorismate lyase  44.44 
 
 		 230 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4627  chorismate pyruvate lyase  29.49 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0933  chorismate lyase  44.68 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4490  chorismate pyruvate lyase  29.49 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.232618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4425  chorismate pyruvate lyase  29.49 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4575  chorismate pyruvate lyase  29.49 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4576  chorismate pyruvate lyase  29.49 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464602  normal  0.0352552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4148  chorismate lyase  35.71 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2154  chorismate lyase  28.95 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0095  chorismate lyase  31.76 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0125  putative chorismate--pyruvate lyase  40.43 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4464  chorismate pyruvate lyase  32.05 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1335  chorismate--pyruvate lyase, putative  39.66 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0971  chorismate pyruvate lyase  30.67 
 
 		 171 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00931015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0048  chorismate lyase  39.34 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0823  Chorismate lyase  37.5 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3528  Chorismate lyase  28.41 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>