33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2975 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2975  4-hydroxybenzoate synthetase  100 
 
 		 100 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1215  chorismate lyase superfamily protein  95.6 
 
 		 184 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0710  chorismate lyase  49.44 
 
 		 185 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00949148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1221  Chorismate lyase  33.72 
 
 		 227 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6134  hypothetical protein  40.91 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0157  chorismate lyase  39.51 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3325  chorismate lyase  34.09 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0956  chorismate lyase family protein  34.88 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4410  chorismate lyase  36 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0608691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1006  chorismate lyase family protein  34.88 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.998133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48500  Chorismate lyase  36.67 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0290  chorismate lyase family protein  34.88 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1168  chorismate--pyruvate lyase  34.88 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1159  chorismate--pyruvate lyase  34.88 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0858  chorismate lyase family protein  34.88 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1946  chorismate lyase family protein  34.88 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1319  chorismate lyase family protein  34.88 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70720  hypothetical protein  38.64 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5317  chorismate lyase  34.07 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2262  chorismate lyase  34.83 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5364  chorismate lyase  34.07 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0933  chorismate lyase  36.17 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5225  chorismate lyase  34.07 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2382  chorismate lyase  36.26 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1734  chorismate lyase  31.03 
 
 		 198 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2346  chorismate lyase  31.03 
 
 		 198 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2367  chorismate lyase  31.03 
 
 		 198 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2111  chorismate lyase  31.76 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5685  chorismate lyase  31.46 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0048  chorismate lyase  34.67 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0066  chorismate lyase  37.93 
 
 		 192 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.540538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5603  chorismate lyase  36.11 
 
 		 183 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2612  chorismate lyase  30.85 
 
 		 180 aa  40  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>