15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6851 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6851  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1366  Carbohydrate-selective porin OprB  28.24 
 
 		 461 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1290  Carbohydrate-selective porin OprB  25.82 
 
 		 492 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3564  Carbohydrate-selective porin OprB  25.82 
 
 		 486 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3373  carbohydrate-selective porin OprB  26.47 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1274  carbohydrate-selective porin OprB  25.98 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1436  Carbohydrate-selective porin OprB  25.49 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3682  Carbohydrate-selective porin OprB  25.98 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0997  hypothetical protein  27.55 
 
 		 452 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10870  hypothetical protein  26.02 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00009778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3797  Carbohydrate-selective porin OprB  26.51 
 
 		 484 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3489  carbohydrate-selective porin OprB  26.09 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3871  Carbohydrate-selective porin OprB  25.23 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0231495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5314  Carbohydrate-selective porin  27.22 
 
 		 459 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  27.86 
 
 		 480 aa  41.2  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>