19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0141 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 78 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 78 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  80 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  81.33 
 
 		 78 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  82.81 
 
 		 64 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  68 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  56 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  51.72 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  38.16 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.1 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  39.13 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  44.62 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  46.67 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  38.46 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  29.23 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  32.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2833  hypothetical protein  66.67 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>