18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3971 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  882    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  40.09 
 
 
548 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  34.18 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  33.81 
 
 
535 aa  82  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  36.02 
 
 
433 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  37.32 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  34.85 
 
 
475 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  34.36 
 
 
520 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2474  hypothetical protein  31.36 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22339  normal  0.0679408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  28.24 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  35.54 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  31.96 
 
 
479 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3226  hypothetical protein  31.96 
 
 
523 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  32.06 
 
 
795 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  29.56 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  29.29 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  26.28 
 
 
527 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  30.14 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>