26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3158 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  249  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  41.27 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  43.61 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  41.03 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  38.21 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  38.02 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  40.16 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  35.29 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  30.83 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  39.13 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  33.91 
 
 
169 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  37.78 
 
 
198 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  38.26 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  37.1 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  32.28 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0264  hypothetical protein  35.46 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  33.85 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  33.85 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  33.85 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  37.63 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  36.44 
 
 
323 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  31.54 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  30.25 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>