23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2787 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  100 
 
 		 132 aa  248  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  56.25 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  47.97 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  51.72 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  54.17 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  42.73 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  45.16 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0860  TadE family protein  39.81 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1239  TadE family protein  56.06 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  40.57 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  37.1 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  30.77 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  41.88 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  40.74 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  23.36 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  29 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  31.87 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  36.49 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  23.44 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  32.05 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  32.05 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  32.05 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>