More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2797 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  99.38 
 
 
320 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  92.19 
 
 
320 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  94.06 
 
 
320 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  94.06 
 
 
320 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  94.06 
 
 
320 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  87.27 
 
 
322 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  76.64 
 
 
321 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  76.64 
 
 
321 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  76.64 
 
 
321 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  76.32 
 
 
321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  78.5 
 
 
321 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  76.19 
 
 
315 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  76.19 
 
 
315 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  76.19 
 
 
315 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  64.06 
 
 
318 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  64.58 
 
 
318 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.04 
 
 
316 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  50.64 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  49.84 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.73 
 
 
323 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.1 
 
 
323 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.77 
 
 
302 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  54.43 
 
 
299 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.93 
 
 
298 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.72 
 
 
310 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.22 
 
 
312 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.56 
 
 
305 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.68 
 
 
301 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.56 
 
 
296 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.67 
 
 
347 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.78 
 
 
296 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.61 
 
 
303 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.37 
 
 
299 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  50 
 
 
321 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.13 
 
 
293 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.35 
 
 
347 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.78 
 
 
311 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.22 
 
 
296 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.56 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.13 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.56 
 
 
306 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.14 
 
 
297 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.01 
 
 
308 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.01 
 
 
277 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.87 
 
 
300 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.83 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  37.75 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.11 
 
 
296 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.18 
 
 
358 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04570  conserved hypothetical protein  39.16 
 
 
746 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  44.69 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.33 
 
 
287 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.3 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.22 
 
 
309 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.34 
 
 
318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.34 
 
 
318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.34 
 
 
318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.15 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.26 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.61 
 
 
294 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 
417 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.94 
 
 
325 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  40.72 
 
 
326 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.94 
 
 
298 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.05 
 
 
303 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.6 
 
 
361 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  43.9 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  37.54 
 
 
561 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  39.41 
 
 
297 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.74 
 
 
396 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.93 
 
 
335 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.74 
 
 
349 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  39.08 
 
 
303 aa  158  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  33.99 
 
 
335 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.87 
 
 
323 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
297 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.82 
 
 
354 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 
320 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.56 
 
 
317 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.78 
 
 
319 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  45.45 
 
 
816 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.22 
 
 
303 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.22 
 
 
303 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3818  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.53 
 
 
328 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 
303 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0843  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.24 
 
 
370 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12410  acetyl hydrolase mbtJ  37.7 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.492248  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.46 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.01 
 
 
303 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.48 
 
 
305 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.01 
 
 
303 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.55 
 
 
303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  39.32 
 
 
304 aa  135  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3228  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.59 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.34 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1377  esterase/lipase-like protein  31.74 
 
 
341 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.06 
 
 
328 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>