68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2577 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  99.4 
 
 		 336 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 347 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  89.34 
 
 		 347 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  89.34 
 
 		 347 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  89.34 
 
 		 347 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  90.48 
 
 		 336 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  85.71 
 
 		 337 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  67.35 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  68.26 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  66.86 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  52.38 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  51.2 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0344  high-affinity nickel-transporter  52.87 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  51.68 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  51.68 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  51.68 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  51.68 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  51.68 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0038  high-affinity nickel transporter  53.75 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  50.72 
 
 		 352 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  50.43 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  50.43 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  50.76 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  52.49 
 
 		 362 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  50.73 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  52.4 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  54.21 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  50.3 
 
 		 464 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  51.46 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  50 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  51.29 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  50.3 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  50.3 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  50.3 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  50.3 
 
 		 376 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  55.83 
 
 		 303 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  50.3 
 
 		 426 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  51.47 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  48.63 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  48.63 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1993  hydrogenase nickel incorporation  47.62 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  43.59 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  44.69 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5194  high-affinity nickel-transporter  47.1 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.981457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  38.94 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  47.35 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  41.04 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  41.04 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  42.44 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  38.99 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  38.28 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  46.31 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  37.04 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  38.71 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  41.35 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  42.58 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  35.97 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01630  conserved hypothetical protein  43.25 
 
 		 536 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  40.58 
 
 		 365 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2353  high-affinity nickel-transporter  43.93 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0532549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  37.25 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0248  high-affinity nickel-transporter  38.27 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0397  high-affinity nickel-transporter  37.75 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3945  high-affinity nickel-transporter  30.58 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1533  high-affinity nickel-transporter  33.99 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2397  hypothetical protein  29.59 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2542  hypothetical protein  29.59 
 
 		 238 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3973  high-affinity nickel permease-like protein  51.02 
 
 		 189 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0271178  normal  0.235405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>