62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5045 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  81.61 
 
 		 233 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  30.4 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  29.13 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.52 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.52 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  30.4 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25 
 
 		 878 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25 
 
 		 878 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  26.34 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  30.12 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  30.12 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  30.12 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  23.79 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  25.57 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  26.23 
 
 		 417 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  24.64 
 
 		 508 aa  52  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  31.43 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  27.59 
 
 		 409 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 421 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  21.27 
 
 		 407 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 395 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.33 
 
 		 398 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 399 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.83 
 
 		 576 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.32 
 
 		 423 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 		 407 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  21.76 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.83 
 
 		 576 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  24.51 
 
 		 884 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.48 
 
 		 398 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  20.5 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 391 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 393 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 402 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 395 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  26.09 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  23.6 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  26.32 
 
 		 431 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  21.5 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 387 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  21.66 
 
 		 401 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 		 405 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  21.29 
 
 		 407 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  29.1 
 
 		 411 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 392 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 388 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  21.46 
 
 		 576 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>