30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4925 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  97.6 
 
 		 125 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  85.6 
 
 		 125 aa  213  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  81.6 
 
 		 125 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  42.18 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  42.95 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2708  hypothetical protein  40.83 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  37.04 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  34.71 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  35.2 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  37.14 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  36.14 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  37.14 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  37.14 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  37.14 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  37.31 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  32.79 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3086  hypothetical protein  29.87 
 
 		 142 aa  40.8  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2526  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4629  hypothetical protein  28.35 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  32.58 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2061  putative lipoprotein  32.81 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0141524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1841  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.485932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>