60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4676 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4676  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499819  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4151  GCN5-related N-acetyltransferase  98.1 
 
 
186 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0946  GCN5-related N-acetyltransferase  82.99 
 
 
175 aa  243  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5514  GCN5-related N-acetyltransferase  80.56 
 
 
175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542593  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  80.56 
 
 
175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3598  GCN5-related N-acetyltransferase  80.56 
 
 
175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3891  GCN5-related N-acetyltransferase  78.81 
 
 
177 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395185  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1524  acetyltransferase  63.19 
 
 
201 aa  163  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1209  acetyltransferase  63.19 
 
 
184 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1282  acetyltransferase  63.19 
 
 
184 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0773193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2473  acetyltransferase  62.5 
 
 
198 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1357  acetyltransferase  62.5 
 
 
198 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0341  acetyltransferase  62.5 
 
 
198 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0950  acetyltransferase  62.5 
 
 
184 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0620  acetyltransferase  62.5 
 
 
184 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.882351  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  51.95 
 
 
182 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5806  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.986614  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2019  putative acetyltransferase  43.79 
 
 
173 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.380338  normal  0.0216614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0496  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
182 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
178 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.546651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  37.66 
 
 
169 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122562  normal  0.91732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2518  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5097  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2969  putative acetyltransferase  34.84 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35200  putative acetyltransferase  34.84 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1017  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000447791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2379  acetyltransferase  33.11 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1561  Fis family transcriptional regulator  36.59 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
170 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  36.89 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
192 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967837  normal  0.139051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0661  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2871  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0236  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1922  acetyltransferase  31.03 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3592  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.41665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  28.57 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  30.16 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0909  acetyltransferase  27.37 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1367  acetyltransferase, GNAT family  39.06 
 
 
148 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.027208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342216  hitchhiker  0.0000380368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
154 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2437  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0538  acetyltransferase  32.47 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.366943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0491515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6953  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>