53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1367 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1367  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.027208  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0750  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
152 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0100469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2669  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
141 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
149 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2880  acetyltransferase, gnat family  41.35 
 
 
152 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4605  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
175 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3958  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 
165 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3882  GCN5-related N-acetyltransferase  38.84 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.130204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2869  acetyltransferase, GNAT family  42.28 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2912  acetyltransferase, gnat family  42.11 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2623  acetyltransferase  41.35 
 
 
151 aa  87  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000382357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2671  acetyltransferase  42.28 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2864  GNAT family acetyltransferase  42.28 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0024  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2592  acetyltransferase  41.61 
 
 
148 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000438891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2895  acetyltransferase  44.74 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000523845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3368  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3659  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0962  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0013  GNAT family acetyltransferase  30.66 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  32.18 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  32.18 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  32.18 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  32.18 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4151  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2364  acetyltransferase  43.06 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  35 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2934  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
368 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4676  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499819  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
156 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  31.88 
 
 
199 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
309 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
343 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  29.89 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  33.78 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  33.01 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  33.78 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  29.47 
 
 
167 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003207  hypothetical protein  31.33 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
193 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  23.47 
 
 
163 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>