68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1574 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  94.89 
 
 		 352 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 352 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  80.68 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  80.74 
 
 		 426 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  80.74 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  80.74 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  80.74 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  80.74 
 
 		 376 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  82.03 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  82.03 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  56.76 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0038  high-affinity nickel transporter  59.36 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  57.02 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  56.59 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  57.27 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  58.41 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0344  high-affinity nickel-transporter  53.28 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  58.11 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  57.69 
 
 		 354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  53.13 
 
 		 352 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  53.13 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  53.13 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  50.59 
 
 		 337 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  50.44 
 
 		 337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  50.59 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  50.59 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  50.59 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  52.85 
 
 		 336 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  52.55 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  55.56 
 
 		 339 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  54.9 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  52.55 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  52.2 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  52.62 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  53.15 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  51.51 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  50.73 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  49.28 
 
 		 342 aa  312  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  52.55 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  54.18 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  47.59 
 
 		 350 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  47.59 
 
 		 350 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1993  hydrogenase nickel incorporation  49.05 
 
 		 375 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  44.37 
 
 		 378 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  44.04 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5194  high-affinity nickel-transporter  45.27 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  42.35 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  45.25 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  42.07 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  43.92 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  41.52 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  39.8 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  40.97 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  43.93 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  36.88 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  39.94 
 
 		 445 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  37.12 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2353  high-affinity nickel-transporter  46.91 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0532549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  43.01 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01630  conserved hypothetical protein  43.65 
 
 		 536 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0397  high-affinity nickel-transporter  37.83 
 
 		 347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0248  high-affinity nickel-transporter  38.11 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  36.95 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3945  high-affinity nickel-transporter  33.61 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1533  high-affinity nickel-transporter  31.53 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2397  hypothetical protein  27.57 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2542  hypothetical protein  27.1 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3973  high-affinity nickel permease-like protein  43.75 
 
 		 189 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0271178  normal  0.235405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>