16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2482 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2482  transposase  100 
 
 
93 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527484  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2344  transposase, truncated  100 
 
 
93 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1758  transposase, truncated  98.92 
 
 
93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1612  transposase, truncated  98.89 
 
 
90 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  44.58 
 
 
238 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  43.37 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  41.18 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  40.23 
 
 
341 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  39.08 
 
 
263 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  45.31 
 
 
212 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  34.29 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  34.29 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  35.71 
 
 
206 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  34.29 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  37.7 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0988  IS1327 transposase  39.58 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>