20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1760 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1760  hypothetical protein  100 
 
 
721 aa  1397    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1600  outer membrane efflux protein  96.74 
 
 
295 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1371  outer membrane efflux protein  94.35 
 
 
269 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0644375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0503  putative outer membrane protein  94.35 
 
 
269 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  75.35 
 
 
519 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  75.35 
 
 
515 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  66.46 
 
 
514 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  66.46 
 
 
514 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  67.08 
 
 
514 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  66.46 
 
 
514 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  66.46 
 
 
513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  60.53 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  60.4 
 
 
520 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  60.43 
 
 
509 aa  164  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  57.86 
 
 
508 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  51.75 
 
 
527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  43.03 
 
 
521 aa  121  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  31.74 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>