33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3684 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  83.28 
 
 		 358 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  81 
 
 		 331 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  76 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  64.9 
 
 		 342 aa  407  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  60.13 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  60.47 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  59.93 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  60.54 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  51 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  50.33 
 
 		 374 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  50.66 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  36.42 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  34.56 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  37.05 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  35.76 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  35.62 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  48.95 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  78.31 
 
 		 136 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  31.01 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  32.89 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  30.07 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  34.26 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  27.05 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  27.98 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  33.15 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  27.15 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  29.05 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  26.94 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  27.42 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  23.81 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  24.79 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>