32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0420 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
151 aa  296  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  66.42 
 
 
143 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.82 
 
 
151 aa  156  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.4 
 
 
152 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 
153 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
146 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.93 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.91 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.84 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  34.86 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.2 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.46 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.68 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.66 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2329  hypothetical protein  29.09 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.41 
 
 
133 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.04 
 
 
134 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.18 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.51 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.51 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>