35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2726 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  83.33 
 
 
358 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  76.13 
 
 
331 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  81 
 
 
300 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  67.48 
 
 
342 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  63.44 
 
 
334 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  60.75 
 
 
334 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  60.87 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  60.69 
 
 
342 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  51.06 
 
 
374 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  51.25 
 
 
374 aa  335  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  51.1 
 
 
368 aa  328  8e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  92.45 
 
 
136 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.78 
 
 
306 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  35.44 
 
 
311 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  36.31 
 
 
311 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  35.67 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  33.44 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  46.11 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  33.13 
 
 
338 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  32.52 
 
 
338 aa  145  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  34.15 
 
 
322 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.75 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  27.87 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  28.19 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  26.32 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  32.8 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  26.88 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  25.71 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  28.57 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  27.37 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6282  phage-related protein endonuclease-like protein  27.67 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  22.08 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  29.03 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>