15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1612 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1758  transposase, truncated  100 
 
 
93 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1612  transposase, truncated  100 
 
 
90 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2482  transposase  98.89 
 
 
93 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527484  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2344  transposase, truncated  98.89 
 
 
93 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  43.37 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  42.17 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  40 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  41.38 
 
 
341 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  40.23 
 
 
263 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  43.75 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  35.71 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  34.29 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  32.86 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0988  IS1327 transposase  39.58 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  32.86 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>