27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0504 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3069    100 
 
 
627 bp  862    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1414  hypothetical protein  96.75 
 
 
423 bp  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0504    100 
 
 
435 bp  862    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0649  hypothetical protein  100 
 
 
627 bp  862    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1218  hypothetical protein  100 
 
 
501 bp  862    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1546  hypothetical protein  91.99 
 
 
621 bp  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1443  hypothetical protein  92.29 
 
 
438 bp  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  94 
 
 
1128 bp  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  88.89 
 
 
1140 bp  79.8  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0048  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  85.06 
 
 
1128 bp  69.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  85.06 
 
 
1128 bp  69.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  91.3 
 
 
1128 bp  60  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  87.72 
 
 
1125 bp  58  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  87.72 
 
 
1131 bp  58  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  87.72 
 
 
1131 bp  58  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  87.72 
 
 
1125 bp  58  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  87.72 
 
 
1131 bp  58  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  87.72 
 
 
1131 bp  58  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  87.72 
 
 
1125 bp  58  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  96.88 
 
 
86 bp  56  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  84.85 
 
 
1140 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  87.04 
 
 
1125 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0035  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  52  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  93.94 
 
 
1164 bp  50.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  96.3 
 
 
1161 bp  46.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>