20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1982 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
433 aa  886    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  39.05 
 
 
535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  36.02 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3226  hypothetical protein  27.97 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  39.16 
 
 
548 aa  77  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  41.13 
 
 
520 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  36.42 
 
 
479 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  35.93 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  33.55 
 
 
463 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  31.17 
 
 
510 aa  60.5  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  32.84 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  33.8 
 
 
795 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  36.27 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  30.28 
 
 
540 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2474  hypothetical protein  32.47 
 
 
424 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22339  normal  0.0679408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  32.87 
 
 
454 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  31.54 
 
 
527 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.09 
 
 
1949 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  30.84 
 
 
293 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  27.59 
 
 
293 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>