23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0034 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  70.93 
 
 
473 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  948    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  65.52 
 
 
479 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  66.59 
 
 
469 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  64.07 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06331  hypothetical protein  60.61 
 
 
430 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.13594  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0409  hypothetical protein  54.62 
 
 
430 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.809492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  54.62 
 
 
430 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1045  hypothetical protein  56.21 
 
 
404 aa  498  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1799  hypothetical protein  55.46 
 
 
451 aa  494  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07871  hypothetical protein  49.57 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0459178  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08551  hypothetical protein  50.11 
 
 
438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07871  hypothetical protein  48.93 
 
 
439 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0737  hypothetical protein  50.43 
 
 
439 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00875447  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  48.96 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1000  hypothetical protein  49.46 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0413832  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0376  hypothetical protein  32.99 
 
 
505 aa  97.4  5e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  26.9 
 
 
424 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  27.37 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  22.87 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  24.01 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  23.4 
 
 
425 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  25.79 
 
 
373 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.459037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>