More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6817 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6817  transposase  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  74.65 
 
 		 359 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  78.46 
 
 		 309 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  78.46 
 
 		 309 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  78.46 
 
 		 309 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7753  putative transposase  66.18 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.0854702 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  78.46 
 
 		 309 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  78.46 
 
 		 306 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  78.46 
 
 		 375 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  76.92 
 
 		 309 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  76.92 
 
 		 309 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  76.92 
 
 		 309 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  76.92 
 
 		 309 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  72 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  42.34 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  42.34 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  42.34 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  42.34 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  60.66 
 
 		 372 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  40.54 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  40.54 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  40.54 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  40.54 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  40.54 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  44.14 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  44.14 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  44.14 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  45.16 
 
 		 393 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  51.19 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  57.38 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  54.1 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  54.1 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  54.1 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  54.1 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  54.1 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 309 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  55.74 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 277 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  55.74 
 
 		 267 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  55.74 
 
 		 206 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  67.39 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0736  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0884  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293625  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0916  IS1404 transposase  65.96 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.08835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  65.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>