25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4053 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  58.14 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  56.52 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  56.96 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  57.35 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  57.35 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  61.11 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0020  hypothetical protein  47.44 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  49.43 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  37.08 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  65.85 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  51.56 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  44.19 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  54.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  45.57 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  75 
 
 		 83 aa  40.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  44.71 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  54.55 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.21 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  39.24 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  43.37 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1323  pyruvate kinase  42.05 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  57.14 
 
 		 83 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>