More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1538 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1538  transposase  100 
 
 
80 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131627  normal  0.237147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  71.25 
 
 
140 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  54.43 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  56.25 
 
 
143 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  50.63 
 
 
136 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1946  transposase IS200  49.37 
 
 
107 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  49.33 
 
 
151 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  43.04 
 
 
158 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  44.87 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  46.84 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  45.45 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  46.84 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  46.84 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  46.84 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  43.04 
 
 
158 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  47.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  44.87 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
151 aa  87  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  46.15 
 
 
152 aa  87  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  46.67 
 
 
154 aa  87  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  46.67 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  44.3 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  44.3 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  43.59 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2878  insertion sequence transposase  44.3 
 
 
178 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1048  transposase  44.3 
 
 
170 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777104  normal  0.0145737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3316  transposase IS200-family protein  44.3 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2930  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2283  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2812  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.67972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3388  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601978  normal  0.413736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3359  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.766936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1992  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2598  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2584  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000573294  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0736  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0335566  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1439  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.413019  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1487  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.242166  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1602  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2332  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000426065  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2303  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.906471  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2469  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.627217  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2528  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1620  IS1541 transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.61818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  44.3 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>